3-gatsu no Lion bercerita tentang Kiriyama Rei sejak kecil telah kehilangan keluarganya karena suatu kejadian yang cukup tragis . Apa yang menimpa keluarganya itu telah meninggalkan luka yang dalam pada hatinya . Meskipun begitu , Rei yang sekarang sudah menginjak umur 17 tahun , hanya ingin fokus menjadi pemain shogi profesional . Suatu hari , Rei yang hidup sendirian di kota Tokyo bertemu dengan 3 perempuan bersaudara; Akari, Hinata dan Momo . Sejak itu kehidupan Rei perlahan mulai berubah yang awal nya memimiliki sifat yang tertutup dan cuek.